Bioinformatics - Page 3

**haichit.** · #21 (**permalink**) 02-03-2010

Chú KP đúng là chưa PhD nên không biết gì. B là minimum để nhận stipend. B- thì hết tiền luôn. Nói chung là học graduate course bên Bio thì mình hơi đuối vì đại học có học đâu. Mà mấy ông thầy toàn lấy research của mình ra để làm problem sets nên chả tìm đâu được đáp án cả

. Đợt trước làm exam dài gần 20 trang, mà mỗi câu hỏi mình viết có một tẹo kiểu để được chấm điểm vở sạch chữ đẹp, may mà không bị B-.

hú hồn, suýt trượt.

Nếu ai mà muốn làm bên CS + bio thì cũng chả phải mất công học mấy thứ cell bio làm gì. Kiến thức thì rộng lắm, học cả đời cũng chả hết, chỉ cần nắm cấu trúc protein, DNA/RNA, cell, mấy quá trình tổng hợp, ... thôi. Nếu thế thì phải học cả mổ chuột nữa

.

Mê Nấm · #22 (**permalink**) 02-03-2010

Nếu các bạn gặp khó khăn về TA, chúng tôi đã chuyển ngữ cuốn Molecular cell biology của Lodish, dự kiến xuất bản năm nay.
Không biết các bạn approach bioinformatics từ hướng nào. Các bạn tôi quen là dân sinh làm Tin, ví dụ modelling một protein và kiểm nghiệm bằng thực nghiệm những prediction hoặc hypothesis từ máy tính. Một số dân Tin làm Bioinformatics như Hồ Tú Bảo, Lê Sĩ Vinh và Lê Sĩ Quang thì mọi người đã biết rồi.

Pisces · #23 (**permalink**) 02-03-2010

Bác MeNam là GV về sinh học ở VN? Nếu đúng thì hay quá. Có 1 số vấn đề về sinh học em chưa hiểu rõ lắm, nếu dc mong bác chỉ giáo.

Em tiếp cận từ hướng CS. Mới bắt đầu chưa lâu.

**haichit.** · #24 (**permalink**) 02-03-2010

	Trích:	MeNam
	Nếu các bạn gặp khó khăn về TA, chúng tôi đã chuyển ngữ cuốn Molecular cell biology của Lodish, dự kiến xuất bản năm nay. Không biết các bạn approach bioinformatics từ hướng nào. Các bạn tôi quen là dân sinh làm Tin, ví dụ modelling một protein và kiểm nghiệm bằng thực nghiệm những prediction hoặc hypothesis từ máy tính. Một số dân Tin làm Bioinformatics như Hồ Tú Bảo, Lê Sĩ Vinh và Lê Sĩ Quang thì mọi người đã biết rồi.

Bạn của bác làm về protein modeling thì cụ thể làm những gì, tớ có đá qua về cái này nên cũng tò mò chút. Hướng nghiên cứu của tớ là phát triển forcefield và solvent model.

Mê Nấm · #25 (**permalink**) 02-05-2010

Vâng, mời các bạn cứ đặt câu hỏi. Không chắc tôi đã giải đáp được nhưng như thế cũng để tôi cùng học hỏi luôn.
Bạn mình làm về cytochrome P450. Mình không rành về bioinformatics. Chỉ xài vài công cụ như BLAST, multiple alignment thôi.

hoctro · #26 (**permalink**) 07-08-2010

Bác Pisces viết bài tổng hợp xong chưa vậy? Mình là dân statistics "chuẩn bị" làm về biochemistry, nên hi vọng sẽ học hỏi từ bác.

	Trích:	Pisces
	Cũng không nhất thiết phải đọc từ đầu. Nếu muốn biết khái niệm 1 cách chung chung thì lên wiki đọc cũng dc. Thường thì dân làm tin sinh học hay quan tâm chủ yếu đến mảng kiến thức về sinh học phân tử, tế bào. Bạn gì đó có thể google wiki khái niệm cơ bản nhất là Central Dogma of Molecular Biology, từ đó đọc lan ra một số khái niệm cơ bản tiếp theo như DNA, RNA, protein cũng như các quá trình chuyển hoá (transfers). Sau đó thì đọc thêm dần dần các khái niệm liên quan (rộng hơn cũng như sâu hơn). Từ từ bạn sẽ có 1 "big picture" của lĩnh vực (chưa nhất thiết phải hiểu sâu sắc). Khi đã có 1 "big picture" kiểu như trên về sinh học (phân tử) rồi, bạn google tiếp các vấn đề người ta đang quan tâm trong tin sinh học, từ đó chọn 1 (1 số) vấn đề có vẻ "hot" nhất để đọc. Khi đã đi sâu vào 1 vấn đề nào đó trong tin sinh học, nếu thiếu kiến thức về cái gì trong sinh học thì lại đọc thêm. Nghiên cứu là bottom-up mà, ko nhất thiết phải đọc hết tất cả rồi mới làm nghiên cứu. Cuốn "Molecular Biology of the Gene" chẳng hạn, thực ra bạn cũng có thể đọc ngay 1 số phần trong đó dc mà ko nhất thiết phải đọc những cuốn cơ bản trước. Dĩ nhiên là cũng hơi "khó nhằn" 1 chút, nhưng với những kiến thức hoá và sinh còn rơi rớt ở cấp 3 thì vẫn có thể "nuốt" dc cuốn này. Chỉ có điều là tiếng Anh bạn phải tốt tốt tí, và chịu khó học thêm thuật ngữ trong sinh học. Cái nào ko hiểu thì wiki mà đọc, đừng mất công tra từ điển làm gì, ko hiệu quả đâu. Ko nữa thì lên youtube xem các đoạn phim mô tả, trực quan bao giờ cũng dễ hiểu. Tiếc là ở VN hầu như chưa có ai làm về cái này, ko thì bạn theo thầy mà làm là tốt nhất. Thực sự cái này rất khó. Tuy rất mới và rất thú vị nhưng nó cũng rất khó. Nên cân nhắc trước khi lao theo. Nhân đây cũng lưu ý thêm là tin sinh học (bioinformatics) với sinh thống kê (biostatistics) quan tâm đến các vấn đề ko phải lúc nào cũng giống nhau. Cái mà bạn gì nói ở trên dường như dc quan tâm nhiều hơn trong sinh thống kê (hay sinh toán ? - mathematical biology). Còn thuật ngữ sinh học tính toán (computational bilogy) thì rộng hơn (gần như là 1 thuật ngữ bao trùm), bao gồm nhiều lĩnh vực khác nhau tuỳ vào việc dùng các công cụ như thế nào để giải quyết các vấn đề sinh học. Trong đó còn có computational biochemistry và biophysics cũng như nhiều lĩnh vực nữa, trăm hoa đua nở, theo ko kịp. Thôi để lúc nào thu thập dc kha khá kiến thức thì viết vài bài tổng quan vậy (như kiểu bác Thi) để giới thiệu cho bạn nào quan tâm, cũng là dịp để mình hệ thống hoá kiến thức.